MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 61487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	TATAA	2	10	61	70	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019954	ACAA	2	8	107	114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019954	T	6	6	120	125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019954	ATTG	2	8	128	135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019954	GTT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019954	TAT	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019954	TTA	2	6	172	177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019954	TTC	2	6	182	187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019954	GAG	2	6	196	201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019954	T	7	7	203	209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019954	GCA	2	6	236	241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077095
12	NC_019954	CAA	2	6	304	309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	555077095
13	NC_019954	TAA	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077095
14	NC_019954	AAAAC	2	10	425	434	80 %	0 %	0 %	20 %	555077095
15	NC_019954	TGT	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	555077095
16	NC_019954	TGA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
17	NC_019954	AGA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
18	NC_019954	CAT	2	6	550	555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077095
19	NC_019954	TGG	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077095
20	NC_019954	TCGCT	2	10	602	611	0 %	40 %	20 %	40 %	555077095
21	NC_019954	GCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077095
22	NC_019954	T	6	6	662	667	0 %	100 %	0 %	0 %	555077095
23	NC_019954	CATG	2	8	704	711	25 %	25 %	25 %	25 %	555077095
24	NC_019954	TA	3	6	723	728	50 %	50 %	0 %	0 %	555077095
25	NC_019954	CAG	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077095
26	NC_019954	TCTT	2	8	761	768	0 %	75 %	0 %	25 %	555077095
27	NC_019954	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077095
28	NC_019954	TGA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
29	NC_019954	TTC	2	6	853	858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077095
30	NC_019954	ATG	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
31	NC_019954	CCGC	2	8	968	975	0 %	0 %	25 %	75 %	555077095
32	NC_019954	GCC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	555077095
33	NC_019954	A	8	8	1081	1088	100 %	0 %	0 %	0 %	555077095
34	NC_019954	ATG	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
35	NC_019954	ATG	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077095
36	NC_019954	TCA	2	6	1200	1205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077095
37	NC_019954	TTC	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077095
38	NC_019954	GAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
39	NC_019954	GAA	2	6	1338	1343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
40	NC_019954	GAA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077095
41	NC_019954	A	6	6	1547	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	555077095
42	NC_019954	TAA	2	6	1569	1574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077095
43	NC_019954	CAT	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019954	AT	3	6	1699	1704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019954	TTA	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019954	TAC	5	15	1745	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019954	AT	3	6	1767	1772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019954	ATG	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000912
49	NC_019954	GAAT	2	8	2004	2011	50 %	25 %	25 %	0 %	438000912
50	NC_019954	AT	4	8	2130	2137	50 %	50 %	0 %	0 %	438000912
51	NC_019954	TTC	2	6	2208	2213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	438000912
52	NC_019954	GAT	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000912
53	NC_019954	TGGA	2	8	2357	2364	25 %	25 %	50 %	0 %	438000912
54	NC_019954	GAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000912
55	NC_019954	TAA	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000912
56	NC_019954	GAC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000912
57	NC_019954	AAT	2	6	2695	2700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438000912
58	NC_019954	GCA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000912
59	NC_019954	T	6	6	2827	2832	0 %	100 %	0 %	0 %	438000912
60	NC_019954	TAAAA	2	10	2862	2871	80 %	20 %	0 %	0 %	438000912
61	NC_019954	TAT	2	6	2901	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000912
62	NC_019954	ATTTT	2	10	2936	2945	20 %	80 %	0 %	0 %	438000912
63	NC_019954	GAAA	2	8	2984	2991	75 %	0 %	25 %	0 %	438000913
64	NC_019954	T	6	6	3046	3051	0 %	100 %	0 %	0 %	438000913
65	NC_019954	CGG	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	438000913
66	NC_019954	GCT	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000913
67	NC_019954	T	6	6	3278	3283	0 %	100 %	0 %	0 %	555077096
68	NC_019954	TATT	2	8	3324	3331	25 %	75 %	0 %	0 %	555077096
69	NC_019954	AG	3	6	3364	3369	50 %	0 %	50 %	0 %	555077096
70	NC_019954	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	555077096
71	NC_019954	GACA	2	8	3442	3449	50 %	0 %	25 %	25 %	555077096
72	NC_019954	TA	3	6	3456	3461	50 %	50 %	0 %	0 %	555077096
73	NC_019954	A	7	7	3470	3476	100 %	0 %	0 %	0 %	555077096
74	NC_019954	A	7	7	3499	3505	100 %	0 %	0 %	0 %	555077096
75	NC_019954	GGA	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077096
76	NC_019954	TGC	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077096
77	NC_019954	ATC	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077096
78	NC_019954	ATT	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077096
79	NC_019954	GATT	2	8	3882	3889	25 %	50 %	25 %	0 %	555077096
80	NC_019954	GAT	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077096
81	NC_019954	T	7	7	4002	4008	0 %	100 %	0 %	0 %	555077096
82	NC_019954	GAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077096
83	NC_019954	ACAT	2	8	4157	4164	50 %	25 %	0 %	25 %	555077096
84	NC_019954	GCAG	2	8	4166	4173	25 %	0 %	50 %	25 %	555077096
85	NC_019954	ATC	2	6	4193	4198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077096
86	NC_019954	TATT	2	8	4202	4209	25 %	75 %	0 %	0 %	555077096
87	NC_019954	ATTC	2	8	4227	4234	25 %	50 %	0 %	25 %	555077096
88	NC_019954	GGA	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077096
89	NC_019954	A	6	6	4250	4255	100 %	0 %	0 %	0 %	555077096
90	NC_019954	CTG	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077097
91	NC_019954	A	8	8	4335	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	555077097
92	NC_019954	TGG	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077097
93	NC_019954	A	6	6	4406	4411	100 %	0 %	0 %	0 %	555077097
94	NC_019954	ACA	2	6	4445	4450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	555077097
95	NC_019954	TTTA	2	8	4493	4500	25 %	75 %	0 %	0 %	555077097
96	NC_019954	A	7	7	4584	4590	100 %	0 %	0 %	0 %	555077097
97	NC_019954	AGA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077097
98	NC_019954	GAT	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077097
99	NC_019954	AT	3	6	4669	4674	50 %	50 %	0 %	0 %	555077097
100	NC_019954	ATG	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077097
101	NC_019954	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077097
102	NC_019954	TGA	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077097
103	NC_019954	ATAAA	2	10	4748	4757	80 %	20 %	0 %	0 %	555077097
104	NC_019954	A	6	6	4755	4760	100 %	0 %	0 %	0 %	555077097
105	NC_019954	AGT	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000916
106	NC_019954	GAA	2	6	4887	4892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000916
107	NC_019954	TA	3	6	4918	4923	50 %	50 %	0 %	0 %	438000916
108	NC_019954	A	7	7	4941	4947	100 %	0 %	0 %	0 %	438000916
109	NC_019954	CAG	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438000916
110	NC_019954	AAG	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000916
111	NC_019954	ATT	2	6	4973	4978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438000916
112	NC_019954	TG	3	6	5046	5051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019954	A	7	7	5068	5074	100 %	0 %	0 %	0 %	555077098
114	NC_019954	ATG	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
115	NC_019954	AAAAT	2	10	5089	5098	80 %	20 %	0 %	0 %	555077098
116	NC_019954	TA	3	6	5145	5150	50 %	50 %	0 %	0 %	555077098
117	NC_019954	CAT	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077098
118	NC_019954	TGA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
119	NC_019954	GAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
120	NC_019954	TGC	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077098
121	NC_019954	CGG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	555077098
122	NC_019954	TGGA	2	8	5451	5458	25 %	25 %	50 %	0 %	555077098
123	NC_019954	TCT	2	6	5485	5490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077098
124	NC_019954	GAA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077098
125	NC_019954	AT	3	6	5617	5622	50 %	50 %	0 %	0 %	555077098
126	NC_019954	AG	3	6	5637	5642	50 %	0 %	50 %	0 %	555077098
127	NC_019954	TGA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
128	NC_019954	GGT	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077098
129	NC_019954	TGC	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077098
130	NC_019954	GAT	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
131	NC_019954	ATA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077098
132	NC_019954	ATGA	2	8	5940	5947	50 %	25 %	25 %	0 %	555077098
133	NC_019954	AAGGG	2	10	6008	6017	40 %	0 %	60 %	0 %	555077098
134	NC_019954	CAAA	2	8	6066	6073	75 %	0 %	0 %	25 %	555077098
135	NC_019954	TTG	2	6	6106	6111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	555077098
136	NC_019954	GTA	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
137	NC_019954	AGC	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077098
138	NC_019954	TGG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077098
139	NC_019954	GAA	2	6	6456	6461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	555077098
140	NC_019954	GAG	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077098
141	NC_019954	GCTGAT	2	12	6549	6560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	555077098
142	NC_019954	T	7	7	6597	6603	0 %	100 %	0 %	0 %	555077098
143	NC_019954	GCC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	555077098
144	NC_019954	TGA	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077098
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159	NC_019954	AT	3	6	7237	7242	50 %	50 %	0 %	0 %	438000918
160	NC_019954	CCA	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	438000918
161	NC_019954	CTG	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000918
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164	NC_019954	TTC	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	438000918
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173	NC_019954	TGG	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	438000918
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181	NC_019954	AAG	2	6	8070	8075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	438000918
182	NC_019954	TGA	2	6	8301	8306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	438000918
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185	NC_019954	A	6	6	8363	8368	100 %	0 %	0 %	0 %	438000918
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251	NC_019954	A	7	7	11659	11665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_019954	GCT	2	6	12357	12362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438000922
268	NC_019954	TTG	2	6	12418	12423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	438000922
269	NC_019954	GGT	2	6	12442	12447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019954	T	7	7	12476	12482	0 %	100 %	0 %	0 %	438000923
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402	NC_019954	TA	3	6	19106	19111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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